La question semble porter sur l’ordre des mots dans les propositions subordonnées interrogatives indirectes.

En français l’ordre des mots des subordonnées interrogatives indirectes varie selon la nature de la question (présence ou non d’un mot interrogatif) ou la nature du sujet du verbe (si c’est un pronom personnel par exemple).¹

Le fait que la proposition subordonnée interrogative indirecte dépende ou non d’une proposition principale qui est elle aussi une question n’a aucune incidence sur l’ordre des mots de la subordonnée interrogative indirecte.

Ainsi dans les deux phrases suivantes, le cas de la subordonnée doit être étudié exactement de la même façon :

(1) Pourriez-vous me dire où est la Tour Eiffel ?
(2) Je ne savais pas où est la Tour Eiffel.

Seule la phrase (1) est une question directe et doit se terminer pas un point d’interrogation.

Le sujet se place devant le verbe :

1- Dans le cas d’une subordonnée comportant une interrogation totale (subordonnée introduite par si) :

Il m’a demandé si mes enfants ont été reçus au bac.
Peux-tu me dire s’ils ont eu leur bac ?

2- Quand le sujet de la subordonnée interrogative est un pronom personnel :

Peux-tu me dire quand tu arriveras ?
Il veut savoir ce qu’on pense.

On peut mettre le sujet avant ou après le verbe :

quand la subordonnée indirecte est une interrogation partielle (qui interroge sur une circonstance particulière et nécessite l’utilisation d’un mot interrogatif) et que le sujet n’est pas un pronom personnel.
Les exemples suivants sont tous corrects et il n’y pas de différence notoire dans leur usage :

Puis-je savoir ce que ton patron t’a dit ?
Puis-je savoir ce que t’a dit ton patron ?

Je me demande comment Pierre a fait.
Je me demande comment a fait Pierre.
²

Attention avec le verbe être :

Le mot interrogatif qui introduit la subordonnée est sujet du verbe être. Dans les exemples suivants « issue » et « cet homme » sont attributs.

Tout le monde se demande quelle sera l’issue des négociations.
Sais-tu qui est cet homme ?

^{1. Alors qu’en anglais l’ordre des mots de l’interrogation indirecte dans une subordonnée est toujours celui de la phrase déclarative.}

^{2. Par contre si on utilise le pronom personnel sujet, il n’y a qu’une seule possibilité :}

^{Puis-je savoir ce qu’il t’a dit ?
Je me demande comment il a fait.}