Tu peux utiliser l’une des deux phrases “Je pense que le logiciel va marcher” ou bien “Je pense que cela/ça va marcher” où cela/ça fait référence au logiciel.

Tu dois utiliser marcher à l’infinitif puisque tu as deux verbes (aller et marcher) qui se suivent donc le deuxième doit être impérativement à l’infinitif (marcher).

Petit truc pour choisir entre infinitif et participe passé : remplacer ton verbe par un autre verbe qui se termine par -ir (partir, finir, devenir…) et de tester infinitif et participe passé. Cela permet de constater à l’oreille la bonne solution :

Je pense que le logiciel va fini.

Non, ça ne paraît pas correct

Je pense que le logiciel va finir

Voilà qui paraît plus correct, même si cela n’a pas de sens.

Cette logique fonctionne avec des francophones de langue maternelle. Je ne sais pas si cela fonctionnerait avec des personnes dont le français est une langue secondaire.