Le terme « salutation » ne convient pas; je ne connais pas le terme à utiliser mais voyez ceci : http://www.cnrtl.fr/definition/salutation

Terme suggéré (pas nécessairement le terme consacré) : formule d’entrée

La virgule est le résultat seulement d’une coutume uniquement utilisée dans les lettres ou messages écrits, et cela n’a rien à voir avec des principes de grammaire; la logique de la chose est, comme n’importe qui peut le concevoir aisément, que tout ce qui vient en dessous de l’« entrée » (ce qui est appelé « salutation » dans la question) est adressé à la personne nommée; elle permet un simili sur papier de l’acte de s’adresser à quelqu’un de vive voix puisqu’elle indique une légère pause, on pourrait dire même qu’elle permet de le représenter. La première phrase qui suit n’est pas la seule qui soit à l’intention de la personne et les autres phrases devront commencer par une majuscule; il n’y a donc pas de raison de singulariser la première et par cela rendre l’interprétation ambigüe; une majuscule est donc le choix le plus « sain ».

C’est une convention qui fait exception à la règle habituelle.

La formule d’appel est considérée comme une partie indépendante, même si elle se termine par une virgule.

C’est une très bonne question qui trouve une réponse facile :

Il ne s’agit que de typographie. Et, en matière de typographie, il n’est que des usages.

Usage venu de l’habitude de commencer par une lettre capitale une ligne de texte écrite après un passage à la ligne + saut de ligne. (cf poésies)

On notera un fait curieux, Grevisse, grand observateur des usages de la langue va noter, dans sa 13e édition (§ 97, 2°) “on doit mettre une majuscule à cette lettre initiale, malgré la virgule qui la précède.” Il était moins catégorique dans sa 12e édition qui fait disparaître ce doit : “on met la majuscule à cette lettre initiale”…

aMuSAnt noN ?

On notera qu’il en va de même dans les livres lorsque les titres de chapitre commencent une phrase qui va se poursuivre ensuite à la ligne. Beaucoup d’auteurs / éditeurs commenceront la suite par un retrait et une majuscule. Mais… certains (cf Le Clézio / Gallimard) débuteront la suite avec une minuscule sans retrait.

Pour ce qui me concerne, je crois la casse de cette première lettre du texte après l’appel lié au retrait de première ligne. Tu fais un retrait de première ligne => Capitale. Tu n’en fais pas -> bas de casse.