« Par moments » ou « de temps à autres » ou quelle que soit ta tournure favorite va bien, c’est l’autre partie de la phrase qu’il faut modifier :

J’entends un coup sec, par moments. Je vais demander à mon garagiste de jeter un coup d’œil dans le moteur.

Au delà des compléments de temps tu peux utiliser la notion d’aléatoire, une action infréquente revenant de manière aléatoire dans le temps :

J’entends des coups secs aléatoirement.

J’entends des coups secs sporadiquement.

J’entends des coups secs occasionnels.

(J’y ai pensé en lisant How to say "on and off" as in doing something intermittently for a period of time)

Dans le sens “très rare”, il y a plus d’adjectifs que d’adverbes:

accidentel, exceptionnel, extraordinaire, inaccoutumé, inhabituel, insolite, inusité, inusuel, singulier