Comme tu le supposes, « il faut qu’on le déçoive » introduit une notion de volonté de décevoir, ce qui n’est manifestement pas agréable à entendre et qui est donc à éviter.

Tu pourrais utiliser la formulation : « Je suis au regret de vous décevoir mais je n’ai plus cet article. »

Une autre formulation serait « J’ai (bien) peur de vous décevoir, mais… »