On dit Frapper à la bonne porte.

Pour le TLFi

Frapper, verbe.
[…]
II.− Emploi intrans.
A.− [La prép. indique la destination du coup] Frapper à, chez, contre, sur. Frapper sur la table.
♦ Frapper à la porte ou absol. frapper. Demander à entrer.^TLFi

Autrement dit, il s’agit d’un emploi particulier du verbe frapper qui utilise à pour désigner un objet sur lequel on frappe. En particulier, quand on dit frapper à la porte, on sous-entend qu’il s’agit de frapper dessus — en principe avec la main ou avec un objet — pour se faire ouvrir. Si on dit frapper la porte, c’est qu’on la frappe pour autre chose :

[…] le chevalier frappa la porte si furieusement de son pied, que les poteaux et les gonds en furent ébranlés. — (Walter Scott, Ivanhoé, Traduction de l’anglais par Alexandre Dumas, 1820)