D’accord fonctionne comme oui (et non), comme une proposition, donc doit être séparé du reste par une virgule avant ou après (ou un point, …):

D’accord, il fait chaud …

Il fait chaud, d’accord, …

Certes et peut-être peuvent être utilisés comme d’accord (règle précédente):

Certes, il fait chaud, …

Il fait chaud, certes, …

Certes peut être utilisé comme n’importe quel adverbe, au sein d’une phrase, sans virgule:

Certes il fait chaud, …

Il fait certes chaud, …

Il fait peut-être chaud, …

Il fait chaud peut-être, …

Si on veut commencer par l’adverbe, on utilise plutôt la forme inversée:

Peut-être fait-il chaud, …

Les autres positions sont plus rares sans virgule, et se rapportent donc plutôt aux cas précédents (comme d’accord), donc avec une virgule:

Il fait chaud, certes, …

Peut-être, il fait chaud, …

Sûrement est dans le même cas:

Comme d’accord:

Sûrement, il fait chaud, …

Il fait chaud, sûrement, …

Comme un adverbe classique:

Il fait sûrement chaud, …

Sûrement fait-il chaud, …

Sûrement que est du langage parlé, pas rédigé.