Note : La réponse à cette question comporterait les mêmes observations générales faites ici à propos de toutefois. On s’y reportera au besoin.

Pour ce qui est du cas particulier de pourtant :

Pourtant est issu de por tant compris comme à cause de ce fait que, à valeur exclusivement causale donc.
Les opinions divergent sur la première occurrence de sa valeur concessive. Soulet retient le milieu du XII^è. Elle attendra en tout cas le XVI^è avant de devenir régulière.

Selon certains (Ménard, Buridant…) la valeur concessive est portée dès l’ancien français dans les phrases négatives :

“Se tu es riches et mananz, ne soies orgueilleus por tant.”

ne [à cause de ce fait que] pouvant effectivement se comprendre comme malgré cela.

Ce por tant en phrase négative va d’ailleurs dès le XII^è donner lieu à l’apparition d’un authentique connecteur concessif : neportant / nonpourtant.
Connecteur qui ne survivra pas au XVI^è siècle.

NDaCOSwt : Un commentaire suggère un glissement sémantique de por tant.

Pour autant qu’on puisse couper les cheveux en quatre, je laisserai volontiers les spécialistes du français-ancien argumenter.
Pour ma part, je lis por tant au sens causal dans la Séquence de Sainte-Eulalie c’est à dire un des tout premiers textes français.
J’en conclus donc facilement que por tant n’a pas glissé sémantiquement.
Après… peut-être le por tanto latin dont il est issu a-t-il lui glissé… mais cela… c’est : Une autre histoire.

Oui! Il est vrai qu’on rencontrera par la suite por tant parfois en concurrence avec un sens quantitatif.
Ce sens vivra sa vie en toute indépendance de pourtant, porté qu’il sera par la locution pour autant.