Les 2 significations sont possibles et le contexte devrait indiquer laquelle est la plus plausible. Je pense qu’on peut éviter l’ambiguïté simplement en disant :

Ce n’est pas important si tu m’aimes ou pas (=> Whether)

Mais la proposition de Damien en commentaire est tout aussi valable:

Ce n’est pas important que tu m’aimes

On pourrait aussi ajouter “ou pas” ici mais l’ambiguïté est déjà levée avec le “que”