Les deux prononciations s’entendent mais la plus courante est [disemine].

L’autre est plus soignée.

On prononce alors le début du mot comme s’il commençais par dix:

dix – séminé [dissemine]

Le double s est perçu comme un s allongé, mais la différence tient surtout à la première syllabe qui inclut alors un s.

On peut faire un parallèle entre les prononciations respectives de

• La dent, ses dents [ladɑ̃], [sedɑ̃]

et

• Là-dedans, c’est dedans (avec e muet : là d’dans, c’est d’dans) [laddɑ̃], [seddɑ̃]