A – S’il s’agit ici d’une hypothèse :

Supposer que (et subj.) indique le Robert, la phrase correcte :

♦ Supposons que X et Y soient des espaces de Banach.

Et la source CNRTL

♦ Supposons que + subj. : Supposons encore qu’il s’agisse d’une série d’expériences ayant pour objet de déterminer comment la tension de la vapeur d’eau varie avec la température du liquide générateur (Cournot, Fond. connaiss., 1851, p. 65).

♦ En supposant que + ind. ou subj. : Le P. Bougeant échappait à l’argument, en supposant que les bêtes étaient des démons (Renan, Avenir sc., 1890, p. 512).

B – Source
Mais lorsque que la supposition porte sur le passé, sur un fait avéré, l’indicatif (ou même le conditionnel) est de mise, car on émet une hypothèse sur l’origine des faits ou des objets et non sur leur existence propre :

Pourquoi supposez-vous que nous avons fait la guerre ? (Vercors, le silence de la mer, p 70).

…. et même l’impératif :

Suppose qu’elle mange ta part de gâteau !