Arriver en tête : arriver le premier ou avec les premiers,

… c’est l’utilisation courante et comprise par tout un chacun.

Arriver en tête, avec l’idée d’arriver dans la tête, d’arriver jusqu’à
l’intérieur de la tête

… n’est pas usité :
Le en synonyme de dans n’intègre pas le mouvement induit par arriver, mais l’on peut dire :

J’ai en tête un problème que je n’arrive pas à résoudre.

… et on n’arrive plus à le sortir de sa tête (il y est immobile), à penser à autre chose
… il finit par vous sortir par les yeux.