Un geste de transparence, c’est ici une marque de bonne volonté qui consiste à rendre publiques des informations auparavant confidentielles, et plus précisément ici une partie du code source de Parcoursup, logiciel gérant les affectations des bacheliers dans l’enseignement supérieur.

The meaning of geste is the one used by the idiom faire un geste

Faire un geste. Donner un gage de sa bonne volonté sans s’engager réellement pour autant. Lui, c’est un amateur, il y est entré parce qu’il trouvait ça bien, pour faire un geste. Nous, on ne pouvait pas faire autrement (Sartre, Mains sales, 1948, 3etabl., 3, p. 99). Faire (avoir) un geste (généreux). En matière d’assistance, apporter une contribution modeste à défaut d’une plus importante. Monsieur Alessandrovici, vous avez eu un geste généreux. C’est très beau, c’est très chic, très noble (Aymé, Tête autres, 1952, p. 236).

The meaning of transparence is that one:

Qualité d’une institution qui informe complètement sur son fonctionnement, ses pratiques. Au niveau de l’entreprise de presse, l’esprit a été de concevoir, dès 1936, une réglementation par laquelle serait obtenue la « transparence » (connaître le véritable responsable et les véritables ressources), condition de la loyauté (Belorgey, Gouvern. et admin. Fr., 1967, p. 144).

Ref: TLFi.