L’expression “Le truc c’est que” traduit une opposition. Il y a une myriade de substitutions possibles pour cette expression.

Si on resserre un peu plus la sémantique, en précisant un peu plus le type d’opposition exprimé, on peut dire qu’il s’agit d’un détail défaillant qui rend un ensemble non fonctionnel ou qui ne remplit pas son but.
Pour faire plus court : “J’ai reçu tous les éléments de la machine, le truc c’est que j’ai oublié ma caisse à outils. Ce n’est pas grand chose mais du coup on ne peut plus avancer”.

Dans ce cas, parmi les propositions qui me semblent le plus appropriées, il y a :

• Sauf que
• Seulement
• Cependant