Tu as raison en disant que ça semble indiquer ‘compte tenu de’.

Pour que, pour… que + indicatif, subjonctif ou conditionnel.

Donc ‘pour que’ peut être subjonctif ou conditionnel. Dans ce sens-ci, il me semble que ‘pour que’ soit conditionnel.

« Pour que » indique ici la conséquence, pas le but. La proposition principale « ça devait être très important » indique la raison qui explique ce qui est exprimé dans la subordonnée : « pour que quelqu’un de haut placé fasse détruire une pièce à conviction ».

La principale ne met pas en doute la destruction, une pièce à conviction a donc bien été détruite. Le verbe « devoir » exprime seulement une incertitude sur le niveau d’importance de la pièce. La subordonnée utilise le subjonctif car bien que la destruction ait eu lieu, elle est quand même imaginée. On ne sait pas exactement ce qui s’est passé. L’indicatif aurait été indiqué si la subordonnée avait décrit un fait avéré : « Puisque quelqu’un de haut placé a fait détruire une pièce à conviction, ça devait être très important ».