Le subjonctif est tout de même relié à la subjectivité, à une attitude conjecturale: il n’y a aucun doute lié à la phrase "Je suis certain que vous m’aimez". En revanche dans la phrase "Que vous m’aimiez, j’en suis certain", la première partie est un peu hypothétique, un peu conjecturale et le poids du "j’en suis certain" qui suit est plus un acte de foi qu’une affirmation faite sans l’ombre d’un doute.