En effet, je partage votre observation, la première version proposée « On néglige la contribution capillaire et on suppose que… » ne me semble pas adéquate puisqu’elle revient à reprendre ce fait à votre compte, alors que vous vous contentez d’y faire référence. Puisque vous parlez des choix faits par l’autre auteur dans son article, je pense que c’est ainsi qu’il faut le présenter.

Dans son article, [Nom d’auteur] a choisi de négliger la contribution
capillaire et de supposer que…

Attention que cette tournure (avec le verbe « choisir ») ne s’applique pas forcément à tous les verbes introductifs rencontrés. Si dans un article, on lit « On observe que… », il suffira d’être direct et de dire « Dans son article, [Nom d’auteur] a observé que… ».

En revanche, dans le cas de « négliger », utiliser la même formule directe « [Nom d’auteur] a négligé » sera incorrect, car cela reviendrait à signaler une lacune dans l’article en question, alors que c’était en fait assumé par l’auteur.