Si aucun problème spécifique n’est identifié ou que la situation est floue, on peut tout à fait dire « On ne peut rien faire ».

Si un problème a clairement été identifié on dit en général « On ne peut rien y faire » (on ne peut rien faire/changer à cette situation). La tournure « on n’y peut rien faire » est aussi possible mais c’est soit un peu vieillot, soit relève d’un certain style, on ne l’emploierait pas dans une conversation aujourd’hui.

Il y a aussi la tournure « On n’y peut rien » que Laure mentionne. Celle-là laisserait plus facilement penser que « c’est la vie », « c’est comme ça que ça marche ».