Selon Larousse, ces deux adjectifs ont la même signification :

Tous les dictionnaires que je viens de consulter donnent les adjectifs phylogénétique et phylogénique comme interchangeables.
Je pense que la meilleure précision soit donnée par le Dictionnaire culturel en Langue Française qui indique que « phylogénétique » est le terme actuel qui remplace « phylogénique » depuis depuis 1897.

TLF : Phylogénétique, phylogénique, adj.Relatif à la phylogénèse.

Dictionnaire de terminologie médiacle [Ontogénétique, Ontogénique] Ces adjectifs s’opposent à phylogénétique ou phylogénique, qui caractérisent ce qui se rapporte au développement de l’espèce.

Petit Robert : Phylogénique ou Phylogénétique. Branche de la génétique traitant des modifications d’ordre génétique au sein d’une espèce animale ou végétale.

Le Grand Larousse encyclopédique ne donne qu’un seul terme Phylogénétique.

Wikipedia a un article phylogénétique mais pas d’article phylogénique.