I think best translation would be : “It’s not correct that way”

From my point of view, “comme ça” designates the way a specific thing is happening.

I would use the sentence “ça ne va pas comme ça” to emphasize the fact that I don’t agree with the way itself (“comme ça”).

Let’s make an example:

“Maman, je peux mélanger le beurre avec la farine ?”

“Bien sûr, montre-moi comment tu fais.”

[…]

“Non, ça ne va pas comme ça ! Prends la cuillère avec ta main droite et fais des tours plus rapides, comme ça.”

*elle lui montre le bon geste *

A clearer (maybe) way of phrase it could be : “Comme ça, ça ne va pas”, where the coma separates better the two parts of the sentence.